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第三章 单元测试

1、单选题：
如:我要查找Shi Y在Nature或Science上发表的论文，规范的检索语言是哪一个?
选项：
A:

Shi Y[AU]  AND Nature OR Science[Journal]

B:

Shi Y[AU]   AND (Nature[Journal] OR Science[Journal])

C:

Shi Y[AU]  AND Nature[Journal] OR Science[Journal]

D:

Shi Y[AU]  AND (Nature OR Science)[Journal]

答案:

2、单选题：
分类码PLN在GenBank中表示的是什么？
选项：
A:

哺乳类序列

B:

细菌序列

C:

噬菌体序列

D:

植物、真菌和藻类序列

答案:

3、单选题：
下列选项中哪个是UCSC中的常用的序列比对工具？
选项：
A:

VisiGene

B:

BLAT

C:

TableBrowser

D:

BLAST

答案:

4、判断题：
ExPASy是一个关于核酸分析的重要门户网站。
选项：
A:对
B:错
答案:

5、判断题：
在Entrez系统常用检索的方法中，使用的布尔运算符AND、OR和NOT是可以小写的。
选项：
A:对
B:错
答案:

6、判断题：
在使用EBI search时,如果有特殊字符，需要用“/”进行转义后再进行搜索
选项：
A:对
B:错
答案:

7、判断题：
使用EBI  Search时可以用正则表达式进行搜索，它以“”作为开头和结尾, [hm] ouse表示第一个字母是h或m，后面必须是ouse。
选项：
A:对
B:错
答案:

8、判断题：
UniProt数据库中的UniProtKB没有注释数据，只含有蛋白质的序列信息。
选项：
A:对
B:错
答案:

9、判断题：
在GBFF格式中，特性位置146^197  表示从146到197碱基之间的这段序列。
选项：
A:对
B:错
答案:

10、判断题：
目前最权威的核酸序列数据库是gene数据库。
选项：
A:对
B:错
答案:

第四章 单元测试

1、多选题：
下列选项中，属于蛋白质的计分矩阵的有（）
选项：
A:PAM1
B:BLUSUM62
C:PAM250
D:BLAST
答案:

2、单选题：
在蛋白质序列比对中，两种氨基酸之间的替换在自然界中越容易发生，则这种替换在计分矩阵中对应的数值越大。
选项：
A:正确
B:错误
答案:

3、单选题：
下列各项中能进行蛋白质和蛋白质之间的相似性比较的软件有（）
选项：
A:Blastn
B:Blastp
C:Blastx
D:Tblstn
答案:

4、单选题：
假设蛋白质序列相似度在20%左右，那么比对时应该采用的PAM矩阵是（  ）
选项：
A:PAM20
B:PAM60
C:PAM80
D:PAM250
答案:

5、单选题：
在蛋白质的BLAST程序中，PSI-BLAST指的是（  ）
选项：
A:模式识别迭代BLAST
B:位点特异的迭代BLAST
C:动态规划算法全局比对
D:基本的局部序列比对搜索工具
答案:

6、单选题：
下面哪个程序，可以用来搜索序列GATCCGGAAG的相似序列。
选项：
A:tblastn
B:blastp
C:blastx
D:blastn
答案:

7、单选题：
对于约95%保守的序列，blastn程序的计分参数调整区最好选用以下哪个
选项：
A:匹配是得1分,错配是-2
B:匹配是得1分,错配是-3
C:匹配是得1分,错配是-1
D:匹配是得1分,错配是0
答案:

8、单选题：
替换的编辑操作可以用以下哪个来表示？
选项：
A:Match
B:Delete
C:Replace
D:Insert
答案:

9、单选题：
将序列AAG和AGC进行双序列动态规划算法的局部比对,空位罚分为‐5,打分矩阵如下。回答下列比对中格子①②③中的值是下面哪个选项(    )

选项：
A:2；2；4
B:2；2；2
C:2；4；4
D:2；4；2
答案:

10、判断题：
在进行双序列比对时,可以通过减小空位罚分来实现序列中不出现空位。
选项：
A:对
B:错
答案:

第五章 单元测试

1、单选题：
下列选项中哪个是蛋白质磷酸化位点分析的主要位点？
选项：
A:丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸
B:亮氨酸,苏氨酸,丙氨酸
C:甘氨酸,色氨酸,酪氨酸
D:丝氨酸,甘氨酸,酪氨酸
答案:

2、单选题：
下列选项中，没有密码子偏好性的是哪一个？
选项：
A:RSCU值>1
B:RSCU值<1
C:CAI值=1
D:RSCU值=1
答案:

3、单选题：
蛋白质的信号肽分析工具有许多，下列不属于信号肽分析工具的是哪一个？
选项：
A:Signal-BLAST
B:SigCleave
C:EMBL
D:Phobius
答案:

4、单选题：
下列软件中，不能用于进行碱基组成分析的是(  )
选项：
A:BioEdit
B:DNASTAR
C:GENSCAN
D:DNAMAN
答案:

5、判断题：
从一条核酸序列转变为另一条核酸序列所需要的变换越多，这两条序列的相关性就越大，进化距离就越小，从共同祖先分歧的时间就越晚。
选项：
A:对
B:错
答案:

6、判断题：
在蛋白质的合成过程中，同义密码子的使用概率是不同的。
选项：
A:对
B:错
答案:

7、判断题：
在PCR引物设计中，上下游引物的Tm值越接近越好，引物5′端不能修饰，3′端可以修饰。
选项：
A:对
B:错
答案:

8、判断题：
GC含量高的DNA比GC含量低的DNA更加不稳定。
选项：
A:对
B:错
答案:

9、多选题：
假如你要用原核表达载体pET28a质粒表达一个蛋白，该蛋白的基因CDS如下：>ORF
ATGAACGCTACACACTGCATCTTGGCTTTGCAGCTCTTCCTCATGGCTGTTTCTGGCTGTTACTGCCACG
TGTTGCCGGAATTCAGCCTCAGGAAGCGGAAAAGGAGTCGCTGCTGA酶切位点分析可以用DNAMAN，或在线工具网址：http://nc2.neb.com/NEBcutter2/index.php通过在PCR引物5’端加入酶切位点，扩增该片段后，PCR产物经双酶切接入pET28a载体的多克隆位点（MCS）区，载体MCS区序列如下：

在设计PCR引物时，如果下游引物5’ 端加入的酶切位点是XhoI，上游引物5’ 端理论上可以加入酶切位点有（）

选项：
A:BamHI
B:EcoRI
C:SacI
D:Sal I
E:HindIII
F:NotI
答案:

10、判断题：
原核基因识别任务的重点是识别开放阅读框。
选项：
A:对
B:错
答案:

第六章 单元测试

1、单选题：
当构建分子系统发生树时，需要考虑哪种机制产生的变异?
选项：
A:基因重组
B:碱基替代
C:插入突变
D:缺失突变
答案:

2、单选题：
关于分子时钟假说，下列表达正确的是(   )
选项：
A:所有的蛋白质都保持一个相同的恒定的进化率
B:对于每一个给定的蛋白质,其分子进化速率在所有的进化分支上是大致恒定的
C:对于每一个给定的蛋白质,分子进化的速率是逐步减慢的,就像一个不准时的时钟一样
D:所有的蛋白质进化速率都与化石记录相符合
答案:

3、单选题：
核苷酸替代速率与gamma分布相符合，下列选项中，描述不正确的是(    )

选项：
A:Gamma值大小反应基因各位点进化速率的异质性大小
B:Gamma值大小反映进化速率的大小
C:Gamma值=1,表明基因上各位点的进化速率有显著差异
D:Gamma值<1,表明该基因有很多位点几乎不变
答案:

4、单选题：
判断基因承受的选择压力时，表示中性选择的是下列哪个选项？
选项：
A:ω<1
B:ω>1
C:ω=1
D:ω=0
答案:

5、单选题：

如果两序列间的相似性越高,则它们的同源性就越高。
选项：
A:

B:

答案:

6、单选题：
遗传漂变是生物进化的重要作用力，下列哪种情况下最容易发生遗传漂变？
选项：
A:一个大的封闭生物群体中
B:一个小的封闭生物群体中
C: 一个大的开放生物群体中
D:一个小的开放生物群体中
答案:

7、单选题：
在利用MEGA构建系统发生树时，不能完成下面哪项工作（ ）

选项：
A:构建NJ树
B:构建MP树
C:构建Bayes树
D:构建ML树
答案:

8、单选题：
下面（  ）原则用于确定MP法的最优树？

选项：
A:替代路径最复杂的树
B: 替代速率最快的树
C:替代路径最简单的树
D:似然率最大的树
答案:

9、判断题：
基因进化过程中，转换速率一般比颠换快。
选项：
A:对
B:错
答案: